GPT-4o 是 GPT-4 的增强版本,同时,GPT-4o在对图像的分析能力上也有很大的提升

chatgpt中文网2024-05-20 22:59:0382

GPT-4o GPT-4 的增强版本,具备更高效的自然语言处理能力。

相比于 GPT-4GPT-4o 在理解和生成文本方面更加准确,处理速度更快,并能更好地处理复杂的任务。

同时,GPT-4o在对图像的分析能力上也有很大的提升。

这篇文章会介绍结合Prompt engineering怎样利用GPT-4o对实验中得到的现象进行分析,从而指导我们找到现象背后的原理,同时对图像处理指明方向。

测试图像为Control组和加药组有丝分裂的图像[1]

01

Prompt engineering

Prompt分析:

1、背景和场景描述

I upload two fluorescent images of cell mitosis.

Help me analyze these two images as an expert in cell biology.

The first image is the group treated with a certain drug, and the second one is the control group.

首先描述清楚你 上传的图像是什么:荧光图像(fluorescent images),有丝分裂(mitosis)

场景是什么:分析图像(analyze),作为细胞生物学专家(expert in cell biology)

2、具体需求

1. Describe these two images;

2. Figure out which process of the mitosis may be effected after I add this drug;

3. Which signalling pathway should I focus on;

4. Tell me how to use certain parameters to quantify this phenomenon.

需求最好是一条一条进行描述,把一个复杂任务进行拆分。

3、思维链+小费

Let's work this out in a step by step way to be sure we have the right answer.

If you do it well, I will tip you 10 dollars.

Prompt中加入更好的思维链(Chain-of-Thought (CoT)),从而让GPT-4可以更好完成复杂任务。

"Let's work this out in a step by step way to be sure we have the right answer."

GPT-4 10 dollars小费,也可以提升回答的质量:

来源:https://blog.finxter.com/impact-of-monetary-incentives-on-the-performance-of-gpt-4-turbo-an-experimental-analysis/

02

GTP-4o 图像分析

1、Step 1 描述图像

GPT-4o正确地描述了药物处理组的图像的几个特征:

  • 三个荧光channel分别染的是什么。

  • 染色体似乎聚集在中央,处于异常的中期或中期前期,染色体没有正确排列在赤道板上。

2、Step 2 指出问题

GPT-4o简洁明了地说明了药物处理组,图像的异常:

  • 染色体没有正确排列,这表明药物影响了从中期到后期的过渡。

  • 药物可能干扰了纺锤体的形成染色体排列微管与着丝点的连接

3、Step3 信号通路

GPT-4o提示我们可以沿着纺锤体组装检查点(SAC)通路进行研究,以及这一通路中重要的蛋白。

4、Step4 图像参数量化

图像展示往往需要配合具体的量化参数。

GPT-4o提示我们可以测量以下几个参数:

  • 有丝分裂指数: 计算处于有丝分裂阶段的细胞百分比,比较处理组与对照组。

  • 纺锤体完整性: 通过测量纺锤体长度和微管组织评估纺锤体结构和长度。

  • 染色体排列: 统计染色体排列不整齐的细胞数量或量化染色体到赤道板的距离。

  • 着丝点连接: 通过荧光强度测量分析着丝点与微管的连接状态。

  • 细胞周期分析: 使用流式细胞仪分析细胞在不同细胞周期阶段的分布。

5、总结

对整个分析流程进行总结:

  • 描述: 药物处理组细胞显示染色体排列异常,而对照组细胞显示正常的中期排列。

  • 受影响的过程: 药物可能影响了从中期到后期的过渡。

  • 信号通路: 关注纺锤体组装检查点(SAC)通路。

  • 量化: 使用有丝分裂指数、纺锤体完整性、染色体排列、着丝点连接和细胞周期分析进行量化。

参考文献

1. Patterson, Jesse C et al. “VISAGE Reveals a Targetable Mitotic Spindle Vulnerability in Cancer Cells.” Cell systems vol. 9,1 (2019): 74-92.e8. doi:10.1016/j.cels.2019.05.009

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